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Análisis filogenético de 57 genomas del SARS COV 2. Realizado por un biólogo isleño, hoy residente en Bélgica

The Archipielago Press by The Archipielago Press
29/03/2020
in COVID19
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Autor: Jayson Arley Gutiérrez Betancur
PhD in Systems Biology
VLIZ Marine Institute, Belgium

*Aunque el Dr. Jayson Arley Gutiérrez Betancourt nació en Itagüí Antioquía, se define como isleño ya que desde los 6 meses hasta los 18 años vivió en San Andrés Isla. Fue estudiante de los colegios Instituto Bolivariano y Bautista de la Loma. Es biólogo graduado de la Universidad de Antioquia. Luego curso doctorado en Biotecnología y Biología de Sistemas en Ghent University (Bélgica).

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ANALISIS:

La biología clásica en los libros de texto define cepa como unidades que una vez divergen no pueden estar otra vez en contacto, y si llegan a estarlo tienen baja probabilidad de reproducirse.

Por otra parte, en la Biología de Sistemas Evolutivos de hoy se reconoce que hay un gran potencial de variabilidad que les confiere identidad.

Actualmente, se han identificado 507 variantes del genoma referente del Virus SARS CoV 2 (Wuhan).

La WHO se aferra a la definición de cepa provista por la biología clásica, la cual es conservadora. En la actualidad no hay consenso en la comunidad científica especializada sobre a partir de qué porcentaje de variación genética podría hablarse de nuevas cepas. Hay mínimo 507 candidatos de nuevas cepas y surgirán más, pero no son uniformes en su variación. Algunos strains (cepas potenciales) comparten el 80% de identidad con Wuhan, y otros menos del 60%. Esto indica que los strains del SARS CoV 2 están evolucionando a gran velocidad, en un proceso dinámico llamado adaptive evolution. Por lo tanto, es muy estático, irrealista y restrictivo hablar de una sola cepa. El virus evoluciona.

Los biólogos de sistemas reconocemos que cada strain está asociado a una región, a un país, y existe una relación filogenética entre los strains; es decir, un sólo strain puede emerger a partir de otro, luego el strain previo sería su cepa. Ésto era desconocido para la biología clásica.

Se determina que hay strains emergentes (cepas) porque muestran propiedades biológicas que divergen con respecto a otra que es referente. Es decir, es incierto determinar el número exacto de cepas pero ciertamente no es una sola. Si la comunidad científica especializada No identifica oportunamente las trayectorias evolutivas del virus, será complicado diseñar tests 100% eficaces y obtener una vacuna 100% eficaz y generalizada antes de año y medio.

IMAGEN: con el análisis filogenético preliminar que he realizado a partir de una muestra de 57 genomas del virus en cuestión.

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