La historia del Infotep se remonta a 1.980, periodo durante el cual el país era presidido por Julio César Turbay y el Ministro de Educación, Rodrigo Lloreda Caicedo, quienes escucharon a través de los líderes la necesidad de la comunidad de las islas, en especial de los jóvenes, de contar con una Institución de formación, que posibilitará el acceso a la educación superior desde el territorio insular, sin la necesidad de desplazarse a la Colombia Continental.
De esta manera fue creado en 1980 el INFIP, nombre que recibió inicialmente y que permitió dar paso a la organización y estructuración de los procesos administrativos bajo el liderazgo del Licenciado Ardis Christopher como primer rector.
Inicialmente, Infotep fue pensado con el objetivo de ofertar programas técnicos orientados al recurso humano en Secretariado Bilingüe, Traducción Simultánea y Técnicas de Cabotaje y Pesca, sin embargo, mediante el Decreto 570 de marzo 9 de 1981, cambio el rumbo de la formación, desarrollando programas en Ciencias Contables, Educación Preescolar, Administración de Oficinas Bilingües y Administración Hotelera.
Una vez organizados y definidos los procesos administrativos, se dio inicio a las primeras actividades académicas en el Fondo Educativo Regional (FER), y un año más tarde, se logró a través de gestiones realizadas, que la Intendencia entregara al Instituto en comodato la Antigua Casa Intendencial, lugar donde funciona actualmente Infotep.
En enero de 1982, se dio apertura formal a cuatro programas con 156 estudiantes: Ciencias Contables, Administración Hotelera, Educación Preescolar y Administración de Oficinas Bilingües con una nómina de profesionales de esta región Caribe.
Los rectores que han orientado el rumbo de esta institución que viene transformando nuestra región insular son: Ardis Christopher, Wenceslao Cabrera Ortiz, Anabella Mariano Domínguez, Julia Wilches (Q.E.P.D), María Matilde Rodríguez Jaimes y Nareta Steele Perez, actual rectora del Infotep.
Pasados estos 33 años de historia, y gracias a la gestión de cada uno de los rectores y funcionarios de la institución, el Infotep ha firmado convenios con la Universidad Mariana de Pasto para ofrecer el programa de Licenciatura en Comercio y Contaduría a distancia, de la cual egresaron veinticinco estudiantes; otro convenio con la Universidad Francisco de Paula Santander para ofertar programas de Educación superior en distintas área y entre otros como el que se firma con la Universidad Tecnológica de Pereira y del cual se graduaron 16 jóvenes de las islas en Ingeniería Industrial.
Actualmente uno de los retos de la administración es mejorar continuamente en la calidad de las carreras técnicas, tecnologas y técnicas profesionales para convertir al Infotep en Universidad y continuar transformando nuestra región insular.